借款合同纠纷的处理方式：当事人可以先行协商，协议优先；协商不成的可以请求有关机关进行调解；调解不成的，有仲裁的可以仲裁；没有仲裁的，可以向起诉。
法律依据
《民事诉讼法》第一百二十二条，当事人起诉到人民的民事纠纷，适宜调解的，先行调解，但当事人拒绝调解的除外。