河西学院现有教育、农业、旅游管理三个硕士学位授权点，没有博士学位授权点。
根据学校官网显示，河西学院有省级重点建设学科3个博士后工作站1个（微藻工程）为甘肃省立项建设的硕士学位授予单位与中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室联合培养博士、硕士研究生。
博士后工作站（1个）：“甘肃省凯源生物技术开发中心”博士后工作站