免刑事处罚还是会有案底的。免予刑事处罚，只是免除对被告人刑罚而没有免除被告人的刑事责任，是已经认定行为构成犯罪，但是根据《刑法》规定，不对其进行刑事处罚的一种方式。已经构成犯罪，就会有案底。免予刑事处罚的前提必须确认被告人构成犯罪，有犯罪事实即便没有被判刑，也会有案底。
一、机关对被害人有案底不会留案底吗
根据检察机关不予起诉的三种情形看，被决定不起诉决定的当事人是否会有案底要视具体情况而定：1、如果犯罪嫌疑人是因没有违法犯罪事实而被决定不起诉的，则不会有案底。2、如果犯罪嫌疑人不是因没有违法犯罪事实而被决定不起诉，而且因犯罪情节轻微或具有《刑事诉讼法》第十六条规定的情形之一而被不起诉的，仍会有本应的案底记载。简单说来就是如果检察机关认为犯罪嫌疑人本身不构成犯罪而不予起诉的就不会留下案底，但是如果检察机关是因为犯罪嫌疑人为了犯罪事实但由于某些原因而没有提起诉讼的就会留下案底。仔细想想确实也应该这样，案底本来就是对犯罪行为的一个记录，因此一旦犯罪嫌疑人为了犯罪行为就应当留下案底。
二、孩子爸爸有案底,孩子想以后当兵怎么办
父亲有案底孩子一般不可以当兵，被判了刑或者被宣告有罪但是免予刑事处罚的就会有案底。如果是刑事处罚的案底，孩子去当兵，政治审查是很难通过的。直系亲被刑事处罚，会影响属到直系亲属当兵。子女参军除非有特殊的缺少的技能，如果是治安行政处罚，则不会影响亲属当后。
三、酒驾拘留15天会留案底吗？
酒驾拘留十五天没有案底。案底是针对刑事犯罪，通常只有构成犯罪才有案底，无证酒驾拘留十五天属治安处罚，所以没有案底。酒驾拘留十五天属于行政拘留，没有案底，只有被刑事处罚才会有案底。案底是指某人过去犯法或犯罪行为的记录。又称犯罪人员犯罪记录制度，在我国法律中一般指有过刑事犯罪前科的档案记录，而该犯罪档案一般存放至门与相关国家机关。