农村宅基地房屋办理不动产证流程如下：
1、到不动产登记机构领取并填写不动产登记申请表；
2、提交登记申请表、申请人、代理人身份证明材料、授权委托书等材料；
3、审核材料；
4、符合登记条件的，在受理申请之日起30个工作日内办结手续，核发不动产权属证书。
一、农村宅基地房屋办理不动产证需要材料有：
1、登记申请书；
2、申请人的身份证明；
3、宅基地使用权证明或者集体所有建设用地使用权证明；
4、申请登记房屋符合城乡规划的证明；
5、房屋测绘报告或者村民住房平面图；
6、其他必要材料。
申请村民住房所有权初始登记的，还应当提交申请人属于房屋所在地农村集体经济组织成员的证明。
二、农村不动产证办理条件：
1、权利主体合格；
2、经过公告、听证，利害关系人没有异议，法律、法规规定的其他条件；
3、登记需要提交的相关资料；
4、办理初始登记时，村民自建房屋必须提交宅基地使用证，农村集体组织建设的房屋必须提供集体土地使用证、建设工程规划许可证或乡村建设规划许可证。
法律依据
《不动产登记暂行条例》第六条
国土资源主管部门负责指导、监督全国不动产登记工作。
县级以上地方应当确定一个部门为本行政区域的不动产登记机构，负责不动产登记工作，并接受上级不动产登记主管部门的指导、监督。
《不动产登记暂行条例实施细则》
第四十一条 申请宅基地使用权及房屋所有权首次登记的，应当根据不同情况，提交下列材料：
（一）申请人身份证和户口簿；
（二）不动产权属证书或者有批准权的批准用地的文件等权属来源材料；
（三）房屋符合规划或者建设的相关材料；
（四）权籍调查表、宗地图、房屋平面图以及宗地界址点坐标等有关不动产界址、面积等材料；
（五）其他必要材料。