员工侵占公司5000元以上会涉嫌职务侵占罪，单位可直接起诉或由立案，进行起诉。职务侵占罪指利用职务便利，非法占有本单位财物的行为。
法律分析
员工侵占的起诉方式：单位直接起诉或到立案由进行起诉。员工侵占公司在5000元以上的涉嫌职务侵占罪，会承担相应的法律责任。职务侵占罪是指公司、企业或者其他单位的人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的行为。
拓展延伸
追回被员工侵占的：法律诉讼的步骤与要点
追回被员工侵占的需要进行法律诉讼。首先，确保收集足够的证据，包括相关的财务记录、交易文件和目击证词。其次，寻求法律专业人士的帮助，如律师或法律顾问，以确保诉讼程序符合法律要求。接下来，起诉员工并向提出索赔。在诉讼过程中，要注意遵守规定的时间和程序。此外，与对方进行谈判或调解也是一个解决纠纷的选择。最后，将根据证据和法律规定做出裁决，如果判决有利于您，您可以通过执行程序追回被侵占的。请注意，此答案仅为一般性建议，具体情况应咨询专业律师。
结语
追回被员工侵占的需要法律诉讼。收集足够证据，寻求法律专业人士的帮助，起诉员工并提出索赔。遵守规定的时间和程序，可与对方谈判或调解解决纠纷。根据证据和法律规定做出裁决，如有利于您，通过执行程序追回。具体情况请咨询专业律师。
法律依据
《中华人民共和国刑法》第二百七十一条
公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；
数额巨大的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；
数额特别巨大的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金。国有公司、企业或者其他国有单位中从事公务的人员和国有公司、企业或者其他国有单位委派到非国有公司、企业以及其他单位从事公务的人员有前款行为的，依照本法第三百八十二条、第三百八十三条的规定定罪处罚。