进项税额不能抵扣情形如下：
1、用于非应税项目、免征项目、集体福利或者个人消费的购进货物或者应税劳务；
2、非正常损失的购进货物及相关的应税劳务；
3、非正常损失的在产品、产成品所耗用的购进货物或者应税劳务；
4、财政、税务主管部门规定的纳税人自用消费品；
5、本条第（一）项至第（四）项规定的货物的运输费用和销售免税货物的运输费用。
进项税不能抵扣的原因包括：
1、属于暂行条例列举的不能抵扣的情形；
2、取得不符合规定；
3、超越抵扣规定的时限；
4、抵扣手续不符合规定。
综上所述， 经过认证通过的防伪税控系统开具的专用，在认证通过当月未按有关规定核算其进项税额并申报抵扣的，不得抵扣进项税额。
【法律依据】
《中华人民共和国暂行条例》第九条
纳税人购进货物、劳务、服务、无形资产、不动产，取得的扣税凭证不符合法律、行规或者税务主管部门有关规定的，其进项税额不得从销项税额中抵扣。
第十条
下列项目的进项税额不得从销项税额中抵扣：
（一）用于简易计税方法计税项目、免征项目、集体福利或者个人消费的购进货物、劳务、服务、无形资产和不动产；
（二）非正常损失的购进货物，以及相关的劳务和交通运输服务；
（三）非正常损失的在产品、产成品所耗用的购进货物（不包括固定资产）、劳务和交通运输服务；
（四）规定的其他项目。