法律分析：1、发卡机构不同：农村社保卡是农保卡，农村社会保障公民卡由发卡机构生成，写入发卡机构的基本信息、用户数字证书、个人基本信息，由相关管理部门写入个人社会保险信息、劳动民政信息以及对应的各种密钥等;公司社保卡是社会保障卡，由人力资源和社会保障部门统一规划，由各地人力资源和社会保障部门面向社会发行。
2、功能不同：农村社会保障公民卡为最终农村社会保障对象个体所持有，以个人为管理对象，将养老、医疗、生育等社会保险信息和劳动、民政等相关信息存放其中;公司社保卡作为比较广泛，持卡人不仅可以凭卡办理求职登记和失业登记手续还可以在网上办理有关劳动和社会保障事务等。
3、卡类不同：农村社会保障卡选用16K字节或以上的双界面JAVA卡，遵循劳动和社会保障部的相关标准规定;而社会保障卡采用全国统一标准，社会保障号码是按照《社会保险法》有关规定，采用公民身份证号码制定。
法律依据：《中华人民共和国社会保险法》
第四条 中华人民共和国境内的用人单位和个人依法缴纳社会保险费，有权查询缴费记录、个益记录，要求社会保险经办机构提供社会保险咨询等相关服务。
个人依法享受社会保险待遇，有权监督本单位为其缴费情况。
第五条 县级以上将社会保险事业纳入国民经济和社会发展规划。
国家多渠道筹集社会保险资金。县级以上对社会保险事业给予必要的经费支持。
国家通过税收优惠支持社会保险事业。