法律分析：除以下特殊情况外的刑事案件应由机关立案管辖：1.由人民直接受理，不需要经过侦查的自诉案件;2.由人民直接立案侦查的案件;3.由保卫部门负责侦查的内部发生的刑事案件;4.由机关立案侦查的间谍案;5.由监狱立案侦查的罪犯在监狱内犯罪的案件。
法律依据：《中华人民共和国刑事诉讼法》 第十 第一款 刑事案件的侦查由机关进行，法律另有规定的除外。除以下特殊情况外的刑事案件应由机关立案管辖：(1)由人民直接受理，不需要经过侦查的自诉案件;(2)由人民直接立案侦查的案件;(3)由保卫部门负责侦查的内部发生的刑事案件;(4)由机关立案侦查的间谍案;(5)由监狱立案侦查的罪犯在监狱内犯罪的案件。